История начинается с того, как Бен, его сестра Гвен и дедушка Макс вмешиваются в очередную ситуацию, угрожающую безопасности человечества. Используя Омнитрикс, мальчик с лёгкостью побеждает группировку инопланетных злодеев. Однако в ходе поединка устройство непреднамеренно активирует своего рода "режим самоуничтожения". Это событие запускает обратный отсчёт, после завершения которого артефакт взорвётся и вызовет уничтожение не только самого владельца, но и всей окружающей его материи.
Столкнувшись с этой угрозой, Бен вынужден отправиться в космическое путешествие в поисках создателя прибора, Азмуса, единственного, кто может отключить функцию самоликвидации. Его спутниками в этой опасной миссии становятся его кузина Гвен и Тетракс, один из соратников Плоскогвардейцев и бывших союзников героя. Вместе они проникают в неизведанные уголки космоса, встречаясь с новыми опасностями, загадочными действующими лицами и открытиями, которые ставят под сомнение понимание ребенка о том, что такое Омнитрикс.
Одновременно за героями охотится Вилгакс, давний враг мальчика. Узнав о неисправности устройства, злобный недруг хочет заполучить этот могущественный артефакт и использовать его взрыв для своих злых намерений. Это добавляет к основному конфликту напряжения и опасности, заставляя персонажей спешить и быть крайне осторожными. В поисках Азмуса наши телегерои проходят через серию рискованных испытаний. Они пробираются на секретные базы враждебных инопланетян, посещают самые опасные участки галактики и сталкиваются с целым рядом новых злодеев. Однако в процессе всех этих приключений ребенок начинает осознавать, какой тяжёлой ношей может быть обладание такой великой силой.
