Коралина Джонс с родителями переезжает в новый дом, известный как Пинк Палас, — старинный викторианский особняк с множеством секретов. Её близкие поглощены работой, и девочка чувствует себя одинокой, оставленной наедине со своим воображением. В поисках приключений героиня исследует дом и случайно находит небольшую запертую дверь в стене. Открыв её ночью, девочка обнаруживает таинственный туннель, который переносит её в параллельный мир.
В удивительном альтернативном мире всё кажется ярче и лучше: её родители более внимательны и заботливы, а сам особняк - гораздо оживленнее. Однако на новом месте есть нечто странное - у всех обитателей пуговицы вместо глаз. Эти Другие родственники предлагают Коралине остаться с ними навсегда, если она согласится пришить пуговицы к своим глазам. Первоначальное очарование мира спутывается с мрачным ощущением, что не всё так идеально как кажется.
По мере посещения Другой реальности, героиня начинает замечать, что что-то идёт не так. Она сталкивается с любопытным мальчиком Вайби, который предупреждает её о грозящей опасности. Она узнаёт, что за обликом заботливой матери скрывается зловещая Бельдам, которая заманивает детей в её мир, чтобы завладеть их беззащитными душами.