Весенние каникулы становятся долгожданным временем отдыха для друзей из Школы монстров. Лагуна Блю предлагает всем провести эти дни с её семьёй под водой, и чудовища с радостью соглашаются. Однако их планы резко меняются, когда по пути к месту отдыха их школьный круизный корабль терпит бедствие. Разбросанных по волнам героев прибивает к берегу таинственного тропического островка под названием Остров черепов.
Изначально кажется, что здесь можно расслабиться и насладиться экзотической природой. Однако вскоре герои узнают, что их преследуют далеко не радушные намерения. Остров оказывается ничем иным, как ловушкой. Главная угроза исходит от коварного капитана Блю Одема. Под маской гостеприимного хозяина он скрывает свои злодейские замыслы. Мужчина одержим идеей найти "самого прелестного монстра в мире", чтобы показать его людям и заодно прославиться. С первых же моментов Одема поражает красота Фрэнки Штейн, которую он решает использовать для своих целей.
Девушка, не подозревая о настоящих намерениях капитана, сталкивается с неоднозначными чувствами. С одной стороны, она чувствует себя польщённой вниманием, но с другой — её что-то настораживает. Тем временем её друзья начинают подозревать, что на островке не всё так просто. Следуя за моряком, они обнаруживают мрачные тайны этого места, скрывающие его истинное предназначение.