История сериала начинается с того, что Наклз, уставший от постоянных забот о защите Изумруда Хаоса, решает оставить на время свои обязанности и отправиться на поиски собственных корней. Он получает таинственное сообщение от неизвестного источника, которое намекает на существование других выживших эхидн и отдельной культуры, о которой герой лишь смутно знает из сказаний своего клана. Заинтригованный, но полон сомнений, он отправляется в рискованное путешествие, которое обещает открыть ему истину о его прошлом.
На своём пути Наклз проходит через множество мировых локаций, от пышных лесов до опасных пещер и древних руин. Каждый из этих миров полон своих загадок и испытаний, заставляющих героя не только проявить физическую силу, но и использовать хитрость и стратегическое мышление.
Главным антагонистом мультсериала становится организация, называющая себя "Коготь", собравшая много могущественных артефактов в попытке захватить власть над энергией Хаоса. "Коготь" ищет ключи к древним силам, скрытым глубоко в прошлом эхидн. Они верят, что обладают знанием, способным изменить всю мультивселенную. Персонаж понимает, что только он может остановить их и предотвратить катастрофу вселенского масштаба.