Сюжет начинается с того, что Шэгги переживает сильный стресс после одного из недавних расследований. Спасаясь от страшных событий и перегрузки, команда решает отправиться на отдых, чтобы их друг смог прийти в себя. По совету психолога, друзья направляются в отдалённый курортный городок с горячими источниками, в надежде расслабиться и временно забыть про расследования и пугающие тайны.
Однако их отдых продлился недолго. Как только команда прибывает в небольшой город, они узнают о жуткой местной легенде — древний дух динозавра, прозванного Фантозавром, якобы защитник старинных земель, вновь появился и начал наводить хаос. Мифический террозавр, внушающий ужас своим призрачным рыком, якобы предупреждает местных, чтобы те держались подальше от области, где он "стережёт" что-то важное. Обитатели городка напуганы, слухи распространяются, а бизнес начинает страдать.
Наши герои, естественно, не могут остаться в стороне. Несмотря на изначальное стремление к спокойствию и умиротворению, Велма, Фред и Дафна приступают к разбирательствау странных событий, связанных с огромным призрачным динозавром. Шэгги и Скуби-Ду, хоть и напуганы до ужаса, втягиваются в эту новую тайну. Постепенно они начинают выяснять, что дух доисторического существа может быть чем-то большим, чем просто легенда. Под вопросом оказывается и то, стоит ли вообще доверять рассказам о Фантозавре или всё это — тщательно продуманная мистификация.