Мультик начинается с того, что группа подростков-детективов из Тайного общества Скуби-Ду оказывается в сложной ситуации. После очередного неудачного расследования, в котором команда ошибочно раскрывает "преступление", оказавшееся лишь простым совпадением, они решают взять паузу и узнать, как лучше продолжить свои приключения. Посовещавшись, ребята понимают, что им нужно время для отдыха и обдумывания дальнейших шагов.
Однако спокойствие не задерживается надолго. Неожиданно Шэгги и Скуби получают загадочное послание от их старого друга Винсента Ван Гула, который сообщает о появлении угрозы, связанной с древним и опасным проклятием. Оказывается, друзья ранее поймали и заточили двенадцать злых призраков, но так и не завершили свою миссию, не поймав последнего, тринадцатого привидения. Теперь им предстоит вернуться к незавершённой задаче и столкнуться с самой страшной из всех загадок.
Фред, Дафна и Велма с удивлением узнают, что когда-то Шэгги и Скуби вместе с Винсентом уже встречались с этими потусторонними существами. Заинтригованные перспективой сблизиться с историей своих друзей, они решают отправиться в незабываемое путешествие в Гималаи, где, по словам Ван Гула, и находится последняя зацепка.