Все начинается с того, что друзья решают устроить особый праздник в честь дня рождения Фреда. Его родители приглашают всю команду в роскошный круиз по Бермудскому треугольнику — место, уже давно окруженное мифами и загадками. Шэгги и Скуби, предвкушающие бесконечные горы еды и комфортное времяпрепровождение, с энтузиазмом принимают приглашение. Однако они, как и остальные члены группы, пока не подозревают, что это путешествие станет для них настоящим испытанием.
С самого начала круиза на судне начинают происходить странные события. Закрытые двери кают внезапно открываются сами собой, навигационные приборы работают с перебоями, а капитан корабля и экипаж ведут себя подозрительно. Но настоящие неполадки начинаются, когда группа попадает в шторм, и сгустившиеся сумерки приносят с собой нечто ужасное: таинственные огни в небе и силуэты пиратского корабля, казалось бы, появляющегося из ниоткуда.
Ребятам становится известно, что капитан и его экипаж очень обеспокоены слухами о легендарных призрачных пиратах — пиратской команде, возглавляемой свирепым и беспощадным Скеллигом. Согласно легенде, эти морские разбойники, исчезнувшие много веков назад, бродят по морям в поисках своего утраченного сокровища, уничтожая всех, кто встанет на их пути. Легенда гласит, что они прокляты преследовать волны до тех пор, пока не найдут свои сокровища.