Каждая серия мультсериала представляет собой отдельное расследование, в ходе которого команда сталкивается с разнообразными сверхъестественными сущностями и запутанными случаями. Основное повествование начинается с того, что ребята приняли решение пересечь всю страну на микроавтобусе «Тайна», чтобы исследовать неизвестные места и просто насладиться летом перед тем, как отправиться в колледжи и начать взрослую жизнь.
Компания намеревается лишь немного развеяться и отдохнуть, но практически в каждом городе, который они посещают, начинают происходить странные и мистические события. Тайное общество вновь включается в работу, чтобы разобраться с призраками, монстрами и паранормальными явлениями, которые на первый взгляд пугают жителей и нарушают их повседневную жизнь.
Фред, как по традиции, берет на себя лидерство и координирует расследования, используя свою решительность и организаторские навыки. Дафна становится более эксцентричной и креативной, стараясь как можно больше помочь друзьям и часто выполняя необычные роли и задачи, к которым они не привыкли. Велма остается мозговым центром команды, применяя свои энциклопедические знания и аналитические способности для разгадки самых сложных тайн. Шэгги и Скуби-Ду продолжают радовать зрителей своей комедийной линией, паническим страхом перед монстрами и постоянным аппетитом, что неизбежно приводит к множеству забавных моментов.